Die Struktur des Franchisesystems sieht die KREX GmbH als Franchisegeber und Systemzentrale vor. Franchisenehmer des Systems sind je nach Trägerschaft öffentliche, freigemeinnützige und private Krankenhäuser, wobei der Fokus auf Krankenhäusern in kommunaler Trägerschaft liegt.
Die folgende Abbildung zeigt die grundlegende Struktur des Franchisesystems:
Dem Franchisegeber ist ein Beirat zugeordnet. Pro Franchisenehmer sind dessen Gesellschafter berechtigt, einen Vertreter in den Beirat zu übersenden. Der Beirat dient dem laufenden Erfahrungsaustausch, sowohl zwischen den dort vertretenen Gesellschaftern der angeschlossenen Krankenhäuser als auch zwischen seinen Vertretern und dem Franchisegeber. Darüber hinaus erfolgt über den Beirat die Information über grundlegende Entwicklungen im Franchisesystem durch den Franchisegeber. Der Beirat trifft sich 2x im Jahr zum Erfahrungs- und Informationsaustausch. Die Treffen des Beirats werden durch den Franchisegeber koordiniert und organisiert.
Dem Beirat kommen im Franchisesystem keine Entscheidungs-, Überwachungs- oder Kontrollfunktionen zu. Die erforderlichen regelmäßigen Abstimmungen und Rückkopplungen zu dem jeweiligen Franchiseverhältnis und dessen Ausgestaltung erfolgen nach Bedarf unmittelbar zwischen Franchisegeber, Franchisenehmer und dessen Gesellschafter. Hierbei erfolgt der Rückgriff auf die für den jeweiligen Franchisenehmer ohnehin bestehenden Gremien- und Entscheidungsstrukturen, wie z. B. Aufsichtsratssitzungen und Gesellschafterversammlungen sowie -rücksprachen. Dies gilt auch für die Abstimmung krankenhausübergreifender strategischer Fragestellungen (wie z. B. Kooperationen), die ggf. mehrere Franchisenehmer berühren.
Für die Finanzierung von Investitionsvorhaben stehen den Franchisenehmern sowohl selbst ausgewählte Kapitalgeber zur Verfügung als auch Kooperationspartner des Franchisegebers. Diese Kooperationspartner auf Bankenseite kennen und wertschätzen das KREX-System, so dass dies zu einer Verbesserung des Rating-Ergebnisses und damit der Finanzierungskonditionen für den jeweiligen Franchisenehmer führen kann.